来源:《自然》
研究人员开发出一款名为MetaGraph的搜索引擎,能够快速检索公共数据库中规模惊人的生物数据。该系统整合了七个公共资助数据档案,构建了包含1880万个DNA/RNA序列集和2100亿个氨基酸序列集的可搜索数据库。用户可通过文本指令进行检索,该工具还能无需预先标注即从庞大测序数据中识别深层遗传模式。
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研究人员开发出一款名为MetaGraph的搜索引擎,能够快速检索公共数据库中规模惊人的生物数据。该系统整合了七个公共资助数据档案,构建了包含1880万个DNA/RNA序列集和2100亿个氨基酸序列集的可搜索数据库。用户可通过文本指令进行检索,该工具还能无需预先标注即从庞大测序数据中识别深层遗传模式。
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为保障研究可复现性并促进持续优化,10位研究者联合提出改进科研软件管理的建议。核心措施包括:为所有博士生提供代码共享规范培训、由学术出版商负责建立软件存档库、设立软件维护与保存专项基金。这些方案旨在平衡代码的长期保存需求与开源软件持续迭代特性,提升科研软件质量与可持续性。