新算法PRISM精准识别肿瘤内真实微生物信号

来源:《癌细胞》

美国罗格斯大学癌症研究所开发出一种名为PRISM的计算工具,能有效区分肿瘤组织内真实微生物DNA与实验污染。该工具采用机器学习模型,在已知样本中验证灵敏度与特异性均超90%,优于现有方法。通过分析近4400例肿瘤样本,PRISM发现微生物信号主要集中在头颈、胃肠等与外界相通的组织,而此前部分研究在内部器官肿瘤中检出的“微生物”实为实验室污染。该工具可免费用于学术研究,有助于挖掘现有基因组数据,探索微生物与肿瘤互作机制及潜在治疗靶点。