来源: Biochemistry
美国伊利诺伊大学团队借助AlphaFold3预测,首次确定YcaO酶负责大肠杆菌中uL16蛋白的硫酰胺化修饰,该修饰在肺炎克雷伯菌等病原菌中也存在,但真核生物中未见。这一细菌特异性修饰机制或为未来开发新型抗菌药物提供潜在靶点。
来源: Biochemistry
美国伊利诺伊大学团队借助AlphaFold3预测,首次确定YcaO酶负责大肠杆菌中uL16蛋白的硫酰胺化修饰,该修饰在肺炎克雷伯菌等病原菌中也存在,但真核生物中未见。这一细菌特异性修饰机制或为未来开发新型抗菌药物提供潜在靶点。
来源: Science Advances
德国波鸿鲁尔大学团队发现,丁香假单胞菌利用效应蛋白触发植物细胞中P小体(处理小体)形成,将防御相关的RNA“隔离”,从而大幅削减蛋白质合成。同时,细菌还抑制内质网应激反应,协同调控细胞稳态。该机制为增强植物抗病性提供了新靶点。
来源: Science
斯坦福大学团队发现细菌DRT3防御系统中,Drt3a酶以RNA为模板合成DNA链,而Drt3b酶则利用自身蛋白结构作为模板合成互补链,生成重复序列双链DNA。该蛋白模板化合成途径为生物技术与医学工程开辟了新思路。
来源: 《Nature Microbiology》
希伯来大学研究发现,细菌可通过纳米管交换携带抗药基因的质粒,但一种名为YokF的蛋白可作为分子“门卫”,在转移过程中降解DNA,阻止有益基因扩散。该蛋白广泛存在于革兰氏阳性菌中,显示细菌能主动调控基因流动,为限制抗生素耐药性传播提供了新靶点。
来源:《Food & Function》
北卡罗来纳州立大学对17种发酵食品(如酸奶、布里奶酪、酸面包、味噌等)进行蛋白质组学分析后发现,微生物蛋白可贡献高达11%的总蛋白质量和60%的蛋白种类数。例如布里奶酪中65%的蛋白来自微生物。研究提示,发酵过程中微生物不仅转化底物,还显著改变了食品的蛋白组成,可能影响免疫与肠道健康。
来源: Nature Communications
日本筑波大学在高温热泉中发现一种新型自复制环状RNA,与已知的线状RNA病毒截然不同。该RNA在核苷酸序列上高度独特,代表一新进化枝。研究显示,环状RNA复制子在高温环境中仍具高多样性与生态适应性,为早期生命演化提供了新见解。
来源: Nature Microbiology
研究发现,细菌中的基因转移颗粒(GTA)在宿主细胞内组装后,依靠一个由lypABC三个基因编码的控制枢纽来介导细胞裂解,从而释放GTA颗粒,将DNA“包裹”传递给邻近细菌,实现基因水平转移。有趣的是,LypABC结构上类似抗病毒免疫系统,但已被细菌“改造成”促进基因交换的工具,这可能加速抗生素耐药性的传播。
来源: Science
ISTA等机构研究发现,多细胞蓝细菌Anabaena中的ParMR系统(后更名为CorMR)不再执行质粒/染色体分离功能,而是定位于细胞膜下形成动态双极丝状网络,调控细胞形状。缺失该系统后细胞变圆肿胀。该演化历经从质粒到染色体、组分变化、膜结合能力获得等四步,揭示了蛋白系统功能转换的进化路径,为理解细胞形态控制提供新视角。
来源: 《环境技术与创新》
国际团队建立PDCOGs数据库,识别出62.5万余种微生物蛋白(分51个同源组),可降解11种天然和28种合成塑料。超过95%的原核微生物至少携带一种相关基因,降解潜力受环境生态条件塑造(如土壤和岩内生态系统富集度更高)。研究为开发适配本地条件的生物降解技术提供了路线图。
来源:《自然·通讯》
苏黎世大学研究团队分析苏黎世湖细菌基因组发现,土壤起源的Limnocylindria类细菌在迁入淡水后,有的通过获得鞭毛相关基因增强运动能力,有的则缩减一半基因组,丢弃“无用包袱”以降低资源需求。后者虽更适应新环境,但失去再迁出的潜力。研究揭示了微生物定殖的两种对立演化路径。